Yersinia pestis als Erreger der menschlichen Pest, wurde mikroskopisch durch Untersuchung von Gram, Wright, Giemsa oder Wayson gefärbten Abstrichen von peripherem Blut, Sputum oder Lymphknoten-Proben identifiziert werden. Die Visualisierung von bipolar-färbenden, eiförmigen Gram-negativen Organismen mit einem „Sicherheitsnadel“ -Aussehen erlaubt eine schnelle mutmaßliche Pestdiagnose. Wenn Kulturen negative Ergebnisse liefern und weiterhin eine Pest vermutet wird, ist eine serologische Untersuchung möglich, um die Diagnose zu bestätigen. Eine Serumprobe sollte so früh wie möglich in der Krankheit genommen werden, gefolgt von einer rekonvaleszenten Probe, die 4-6 Wochen oder länger nach Beginn der Krankheit ist